Возьмите MPTOOL последних версий, в настройках снимите все галочки какие возможно, заполните информацию о вашем диске по аналогии с выводом usbdiskinfo (что бы диск не поменял сильно данные в конфиге) и запустите, пройдет формат, по идее этого будет достаточно.