а Windows то какой версии, если XP, то нужно добавить чтото типа
Update (KB955704) - Microsoft exFAT File System Driver,
еще (для WinXP) попадался новый format, в котором можно выбирать exFAT
это я пишу по памяти, с пол года назад разбирался как форматировать флешки в exFAT в LiveCD собраном pebuilder-ом из WinXPSP2.
Думаю что более правильные советы(файлы апдейтов) можно найти на форумах мелкомягких.