Скорее всего не разбирались с настройками, а воспользовались готовым файлом настроек.
Проверьте закладку "Partition Setting" - по-убирайте там все галки!
В "Parametr Input" -> "Config Flash" выбирите название припаянной микросхемы памяти (если вы корпус уже вскрыли)