Блин протупил. Я делал так, но потом там где выбирается прошивка - я галку убирал, думал, что можно без прошивки менять мигалку. Ошибся.
Немного разобрался с параметрами:
LED Ready - похоже, отвечает за то как будет мигать флешка при подключении (но не уверен, в скаченой инструкции говорится, что он отвечает за вкл/выкл LED когда он уже подключен. Но в этой программе за это отвечает галка Device Ready, LED ON)
LED Busy - частота моргания (как и в инструкции)
Duty On и Duty Off - более тонкая настройка моргания. Первый - длительность вспышки, второй пауза между вспышками. Возможно измеряется в миллисекундах.
Device Ready, LED ON - после подключения флешки светодиод горит(не горит) постоянно
LED Flash with access - разрешить(запретить) моргать при доступе к флешке (запись/чтение)
В этой версии программы я не разобрался до конца с параметром LED Ready.