Фирменное утилите – это JFormat, mFormat и Recovery Tool с трансцендовского сайта. А алькоровские - это от производителя контроллера и для контроллера. После неправильного применения алькоровской, трансцендовские не признают флэшку за свою. Чтобы восстановить статус-кво, в алькоровскую надо вбить исходные VID/PID (и серийник желательно). Посмотреть их можно на компе с виндовс, в который эта флэшка втыкалась будучи еще рабочей. (в реестре сохраняются данные о всех когда-либо подключавшихся USB-девайсах). Посмотреть можно например прогой USBdeview. Если при "перепрошивке" алькоровской форматилкой ввести неправильные VID/PID, то и флэшка будет неправильно распознаваться компами (уж точно не как ДжетФлэш)